در پی غیبت استقلالی‌ها در اردوی تیم ملی و حضور در بازی این تیم بدون هماهنگی با کادر فنی تیم ملی، اسکوچیچ این بازیکنان را از تیمش خط زد و پنج بازیکن جدید را به اردو ایران فراخواند.
فدراسیون فوتبال در واکنش به این مسئله بیانیه‌ای را منتشر کرد که به این شرح است: «پیرو تصمیم انضباطی سرمربی محترم تیم ملی فوتبال در خصوص ملی‌پوشان باشگاه استقلال به دلیل عدم حضور به موقع در اردو فدراسیون فوتبال ایران حمایت قاطع خود از آقای اسکوچیچ را اعلام کرده و بر ضرورت توجه به نظم و انضباط در اردوی تیم ملی تاکید می کند.
با این وجود پیرو درخواست باشگاه استقلال جهت تقویت اتحاد و همدلی و اهمیت فرصت طلایی و افتخار پوشیدن پیراهن مقدس تیم ملی با توجه به آنکه لغو مسابقات با تصمیم کمیته مسابقات سازمان لیگ منجر به برگزاری بازی‌های باشگاهی در زمان فیفادی گردیده و اعتراض آقای اسکوچیچ به شرایط غیر حرفه‌ای پیش‌آمده کاملا منطقی است در صورت صلاحدید و موافقت سرمربی محترم تیم ملی امکان حضور ملی‌پوشان این باشگاه در اردو فراهم خواهد شد.
بدیهی است که این تصمیم تنها در حوزه اختیارات سرمربی محترم تیم ملی بوده و فدراسیون فوتبال در صورت موافقت یا عدم موافقت آقای اسکوچیچ قاطعانه از تصمیم ایشان حمایت خواهد کرد.
فدراسیون فوتبال بر ضرورت توجه جدی و اولویت برنامه‌های تیم ملی همچنین ممانعت از تکرار این گونه اتفاقات و انجام مسابقات باشگاهی در مقطع فیفادی که زمان ویژه برگزاری اردوهای تیم ملی است تاکید می‌کند و در صورت تکرار این گونه بی‌نظمی‌ها بازیکنان و باشگاه متخلف با جریمه و محرومیت سنگین و قطعی مواجه خواهند شد.»
